האו"ם הוא המעסיק הגדול ביותר של פלסטינים בעזה, כ-35,000. לאו"ם יש היסטוריה ארוכה של מתן מענקים בחסותו של חברי חמאס, הפועלים תחת אונר"א וסוכנויות אחרות. תחת השם של האו"ם ביצעו פעילים פעולות טרור. בדו"ח שנערך לאחרונה על ידי UN Watch, מוצגות עדויות לעובדי אונר"א שחגגו את הטבח ב-7 באוקטובר והנחו את חמאס: https://unwatch.org/report-u-n-teachers-celebrated-hamas-massacre/. 

למרות שצה"ל אינו מכוון לאזרחים, עובדי האו"ם יכולים להיות למעשה טרוריסטים של חמאס המתחזות לעובדי האו"ם. לפי IMPACT-se שעוקבת אחר בתי הספר של אונר"א, למעלה מ-100 ממחבלי חמאס שמבצעים את הטבח ב-7 באוקטובר הם בוגרי אונר"א. אונר"א הפכה למעשה לזרוע של זרוע האינדוקטרינציה של חמאס כאשר חמאס קובע את תכנית הלימודים הנלמדת בבתי הספר של אונר"א. אונר"א היא גוף של האו"ם רק בשם ומימון, מלבד זה היא לא שונה ממוסדות פלסטיניים אחרים. למשל, שר הכלכלה לשעבר של חמאס עבד באונר"א לפני שמונה לתפקידו. פעילים ותומכי חמאס רבים מועסקים באונר"א והגבול בין אונר"א לחמאס אינו ברור. לדוגמה, בשנת 2001, במהלך טקס הענקת פרסים שנערך במתקן של אונר"א על ידי ארגון לא ממשלתי פלסטיני, דווח על מורה מהסוכנות ששיבח בפומבי מחבלים מתאבדים; בהמשך נאום של השייח' אחמד יאסין, שהיה בזמנו המנהיג "הרוחני" של חמאס. אנשי אונר"א בחו"ל יודעים שאנשי חמאס מועסקים על ידי אונר"א אך נראה שהם לא מוטרדים מכך. הנציב הכללי לשעבר פיטר הנסן אמר ב-2004: "אני בטוח שיש אנשי חמאס במשכורת של אונר"א ואני לא רואה בזה פשע. חמאס, כארגון פוליטי, לא אומר שכל חבר הוא לוחם ואנחנו לא מבצעים בדיקה פוליטית".